256 पेपर
यह अध्ययन पाइरूवेट ब्रांच पॉइंट को एक महत्वपूर्ण चयापचय चेकपॉइंट के रूप में पहचानता है जो कम पाइरूवेट ऑक्सीकरण और साइट्रेट सिंथेस डाउनरेगुलेशन द्वारा चिह्नित एक पुनर्गठित चयापचय प्रोफाइल के माध्यम से माइटोकॉन्ड्रियल ROS और HIF-1α सिग्नलिंग को नियंत्रित करके लिम्फोइड कैंसर सेल प्रसार को विनियमित करता है।
यह अध्ययन एक सुदृढ़ 26-जीन ट्यूमर-सप्रेसर सिग्नेचर विकसित और मान्य करता है जो एडिनोकार्सिनोमा नॉन-स्मॉल सेल लंग कैंसर के रोगियों में रोग के निदान को प्रभावी ढंग से वर्गीकृत करता है और पुनरावृत्ति की भविष्यवाणी करता है, जो कई स्वतंत्र समूहों में मौजूदा रोगनिरोधी मॉडलों की तुलना में बेहतर प्रदर्शन प्रदर्शित करता है।
यह अध्ययन SRRM1 को एक प्रमुख स्प्लिसिंग नियामक के रूप में पहचानता है जो, अक्सर SRSF11 के साथ मिलकर, कई प्रकार के कैंसर में ट्यूमर की वृद्धि, प्रसार और स्टेमनेस को बढ़ावा देने के लिए NUMB और अन्य सिग्नलिंग या साइटोस्केलेटल जीन सहित ऑन्कोजेनिक प्रोटीन आइसोफॉर्म की अभिव्यक्ति को संचालित करता है, जिससे एक चिकित्सीय लक्ष्य के रूप में इसकी क्षमता उजागर होती है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि अनटारगेटेड लॉन्ग-रीड ट्रांसक्रिप्टोम सीक्वेंसिंग को ड्रोसोफिला (Drosophila) में इन विवो कार्यात्मक सत्यापन के साथ संयोजित करने से ग्लियोमा में नवीन, ऑन्कोजेनिक जीन फ्यूजन का पता चलता है जो मानक लक्षित शॉर्ट-रीड फ्यूजन पैनलों द्वारा छूट जाते हैं।
यह शोधपत्र SubNetDL को प्रस्तुत करता है, जो एक सुदृढ़ और व्याख्यात्मक डीप लर्निंग फ्रेमवर्क है जो विभिन्न प्रकार के कैंसर और उपचार पद्धतियों में कैंसर थेरेपी प्रतिक्रियाओं की सटीक भविष्यवाणी करने और नवीन बायोमार्कर की पहचान करने के लिए नेटवर्क प्रोपेगेशन के माध्यम से प्रोटीन-प्रोटीन इंटरेक्शन नेटवर्क के साथ सबक्लोनल म्यूटेशन प्रोफाइल को एकीकृत करता है।
यह अध्ययन एक स्थानिक रूप से विभेदित एजेंट-आधारित मॉडल को एक व्याख्या योग्य मशीन लर्निंग सरोगेट के साथ एकीकृत करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि HER2-पॉजिटिव और HER2-नेगेटिव दोनों कोशिका आबादी को लक्षित करने वाली संयोजन चिकित्सा विषम स्तन कैंसर में फेनोटाइपिक प्लास्टिसिटी-जनित प्रतिरोध को प्रभावी ढंग से दूर करती है, जो उपचार रणनीतियों की भविष्यवाणी करने और उन्हें अनुकूलित करने के लिए एक स्केलेबल ढांचा प्रदान करती है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि PTEN की प्रोटीन फॉस्फेटेज गतिविधि, जो इसके लिपिड फॉस्फेटेज कार्य से भिन्न है, चूहों में सामान्य भ्रूणीय विकास और ट्यूमर दमन के लिए आवश्यक है, जैसा कि उन चूहों में देखे गए भ्रूणीय घातकता और बढ़ी हुई ट्यूमरजनन से सिद्ध होता है जिनमें प्रोटीन फॉस्फेटेज गतिविधि रहित उत्परिवर्तित PTEN व्यक्त होता है।
यह अध्ययन POLQ-संचालित MMEJ विलोपन पदचिह्न (MDF) को होमोलॉगस रीकॉम्बिनेशन-डेफिशिएंट अग्नाशय के कैंसर में एक प्रमुख जीनोमिक मार्कर के रूप में पहचानता है जो नियोएंटीजन को बढ़ाकर इम्युनोजेनेसिटी को बढ़ावा देता है, एंटीजन प्रेजेंटेशन को बढ़ाने के लिए माइलॉयड कोशिकाओं को पुनर्गठित करता है, और उत्पादक टी-सेल इंटरैक्शन को बढ़ावा देता है, जिससे विशिष्ट डीएनए मरम्मत तंत्रों को इम्यूनोथेरेपी के अनुकूल नैदानिक प्रतिक्रियाओं से जोड़ा जाता है।
यह शोधपत्र तीन-ट्रांसक्रिप्शन-फैक्टर जीन नियामक नेटवर्क के एक पीसवाइज़-लीनियर (piecewise-linear) गणितीय मॉडल को प्रस्तुत करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि कैसे प्रबल अंतरकोशिकीय संकेतन (intercellular signaling) जीन अभिव्यक्ति की यात्रा करती तरंगों (travelling waves) को संचालित करता है, जो अंततः मेलानोमा आबादी में प्रमुख कोशिका-अवस्था विशेषता को निर्धारित करता है।
यह अध्ययन MPNST प्रोटिओम की प्रोफाइलिंग के लिए सेल-सरफेस कैप्चर मास स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग करता है, जो यह प्रकट करता है कि PRC2 की हानि विशिष्ट सतह प्रोटीनों के अपरेगुलेशन (upregulation) को प्रेरित करती है और इन आक्रामक ट्यूमरों के उपचार में एंटीबॉडी-ड्रग कंजुगेट्स के लिए PTK7 को एक आशाजनक चिकित्सीय लक्ष्य के रूप में पहचानता है।